磷是植物必需的大量營養(yǎng)元素,主要以磷酸鹽形式被植物從土壤中吸收利用,磷不足會導(dǎo)致水稻等作物嚴(yán)重減產(chǎn)。然而,磷酸鹽在土壤中容易結(jié)合金屬離子而沉淀,流動性差,水稻等作物對磷酸鹽的吸收利用效率低,僅30%左右。為適應(yīng)低磷條件,植物進(jìn)化出了復(fù)雜的磷酸鹽吸收和運(yùn)輸系統(tǒng)。其中,根細(xì)胞質(zhì)膜定位的PHT1家族是植物從土壤中吸收磷酸鹽的主要蛋白,其通過質(zhì)子驅(qū)動力將磷酸根轉(zhuǎn)運(yùn)至細(xì)胞內(nèi)。自首個PHT1鑒定以來,近30年的研究陸續(xù)報(bào)道、揭示了大量PHT1家族蛋白基因,為培育磷高效作物提供了重要靶點(diǎn),但其結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)與轉(zhuǎn)運(yùn)機(jī)制仍不清楚,阻礙了對磷高效作物的開發(fā)。
在水稻中,PHT1家族有13個成員,被命名為OsPHT1;1- OsPHT1;13。其中,OsPHT1;11(OsPT11)參與菌根共生,特異性地被叢枝菌根(arbuscular mycorrhizal)共生誘導(dǎo)表達(dá),貢獻(xiàn)了菌根水稻中超過70%的磷吸收量,為水稻共生吸收土壤中有限的磷營養(yǎng)提供了一個關(guān)鍵路徑,同時也是水稻適應(yīng)低磷土壤環(huán)境的重要策略。
9月25日,華中農(nóng)業(yè)大學(xué)劉主課題組聯(lián)合陳艷可、薛紹武等實(shí)驗(yàn)室,在Developmental Cell在線發(fā)表題為Cryo-EM structure and dynamic basis of phosphate uptake by PHT1 in rice的研究論文,首次報(bào)道了水稻磷酸鹽轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白OsPT11的冷凍電鏡結(jié)構(gòu),結(jié)合單分子熒光共振能量轉(zhuǎn)移(smFRET)技術(shù),對其構(gòu)象變化進(jìn)行了可視化分析,揭示了其識別、轉(zhuǎn)運(yùn)磷酸根的分子機(jī)制。
在本研究中,研究團(tuán)隊(duì)首先建立了一套基于蛋白脂質(zhì)體和放射性同位素檢測OsPT11轉(zhuǎn)運(yùn)磷酸根功能的生化體系,驗(yàn)證了其體外轉(zhuǎn)運(yùn)活性,發(fā)現(xiàn)OsPT11為低親和力轉(zhuǎn)運(yùn)體。基于OsPT11的結(jié)構(gòu)分析,研究團(tuán)隊(duì)揭示了一系列參與磷酸根結(jié)合與轉(zhuǎn)運(yùn)的關(guān)鍵氨基酸位點(diǎn),這些位點(diǎn)在植物中100%保守。另一方面,研究團(tuán)隊(duì)還揭示了OsPT11中由酸性氨基酸形成的質(zhì)子傳遞通道,該通道通過傳遞質(zhì)子驅(qū)動磷酸根的跨膜轉(zhuǎn)運(yùn)。進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn),將磷酸根結(jié)合空腔內(nèi)的特定賴氨酸替換為精氨酸,可以增強(qiáng)磷酸根的結(jié)合能力并提高轉(zhuǎn)運(yùn)活性。這一發(fā)現(xiàn)可能在提高作物磷吸收效率方面具有潛在的應(yīng)用價值。
進(jìn)一步,研究團(tuán)隊(duì)運(yùn)用smFRET技術(shù),在單分子水平可視化分析了OsPT11轉(zhuǎn)運(yùn)磷酸根過程的動態(tài)變化。研究發(fā)現(xiàn)OsPT11在多種構(gòu)象狀態(tài)之間相互轉(zhuǎn)換,其中,當(dāng)胞外朝向(outward-facing)構(gòu)象為主要構(gòu)象時可顯著促進(jìn)磷的轉(zhuǎn)運(yùn)活性。相比之下,胞內(nèi)朝向(inward-facing)構(gòu)象為主時,磷的轉(zhuǎn)運(yùn)活性則降低?;诖耍髡邔Ρ妊芯苛怂靖哂H和力轉(zhuǎn)運(yùn)體OsPHT1;8(OsPT8)的動態(tài)轉(zhuǎn)運(yùn)過程,發(fā)現(xiàn),盡管這兩個轉(zhuǎn)運(yùn)體在磷酸根結(jié)合位點(diǎn)具有保守的氨基酸序列,但其構(gòu)象動態(tài)平衡呈現(xiàn)顯著差異:低親和轉(zhuǎn)運(yùn)體OsPT11以胞內(nèi)朝向構(gòu)象為主,高親和轉(zhuǎn)運(yùn)體OsPT8則以胞外構(gòu)象為主。因此,高、低親和轉(zhuǎn)運(yùn)體這種動態(tài)性質(zhì)上的異質(zhì)性,決定了它們在磷轉(zhuǎn)運(yùn)效率上的高低之分。該研究結(jié)果,很好地解釋了領(lǐng)域內(nèi)一個很有意思的問題:為什么序列相似、結(jié)構(gòu)相同的PHT1轉(zhuǎn)運(yùn)體卻有著不同的磷酸根轉(zhuǎn)運(yùn)能力?
綜上,研究者采用整合結(jié)構(gòu)生物學(xué)策略,聯(lián)合使用冷凍電鏡與單分子熒光技術(shù),結(jié)合生化與細(xì)胞生物學(xué)分析,揭示了OsPT11在質(zhì)子驅(qū)動力下轉(zhuǎn)運(yùn)磷酸根的分子機(jī)制,為闡明植物吸收磷酸鹽的分子機(jī)制提供了新的見解,對于作物磷高效吸收與利用的遺傳改良具有重要的指導(dǎo)意義。
華中農(nóng)業(yè)大學(xué)生命科學(xué)技術(shù)學(xué)院博士生杜張萌,官澤源博士,劉海博士,博士生生張杰和碩士生何海濤為論文共同第一作者。劉主教授、陳艷可博士和薛紹武教授為論文共同通訊作者。中國科學(xué)院技術(shù)大學(xué)冷凍電鏡中心和南方科技大學(xué)冷凍電鏡中心為電鏡數(shù)據(jù)收集提供了重要支撐和幫助,研究工作得到可國家自然科學(xué)基金等項(xiàng)目的支持。
論文連接:https://www.cell.com/developmental-cell/fulltext/S1534-5807(25)00541-6
