臺灣地區(qū)“食藥署”針對基因改造食品已采取原料源頭邊境查驗(yàn)及后市場監(jiān)測的雙重管理機(jī)制。

    在源頭邊境查驗(yàn)管理部分，“食藥署”已針對港埠邊境進(jìn)口報(bào)驗(yàn)項(xiàng)目為非基因改造的大豆及玉米等，在輸入時應(yīng)檢附產(chǎn)品或原料為非基因改造的證明文件，包括IP （Identity preservation）證明、或其他可證明非基改的官方文件、或檢測項(xiàng)目涵蓋所有已通過查驗(yàn)登記基改品系的檢驗(yàn)報(bào)告，并依風(fēng)險管控原則針對抽中批進(jìn)行檢驗(yàn)，以強(qiáng)化非基因改造大豆及玉米的進(jìn)口管理。另如系屬基因改造產(chǎn)品，則應(yīng)檢附出口國廠商出具的聲明文件，載明該批貨物所含轉(zhuǎn)殖品系的國際統(tǒng)一編號或通用代號，文件上敘明“This shipment of soybeans may contain genetically modified event as following…”，或相同意義的說明，文件上還須載明可與該批貨物鏈接的信息。

    在后市場監(jiān)測管理部分，“食藥署”依據(jù)境內(nèi)基因改造食品標(biāo)示制度的實(shí)施，進(jìn)行年度“臺灣市售基因改造食品標(biāo)示調(diào)查”，每年監(jiān)測約250件市售產(chǎn)品，自2003年（不合格率為57.0%）持續(xù)監(jiān)測至2014年，不合格率已降至7.1%，不符合標(biāo)示規(guī)定的市售食品，皆函請轄區(qū)衛(wèi)生局依法處辦并輔導(dǎo)業(yè)者進(jìn)行正確標(biāo)示。另為落實(shí)源頭管理，“食藥署”于2016年度已責(zé)成地方政府衛(wèi)生局，針對境內(nèi)34家資本額3,000萬以上大豆油脂及醬油釀造工廠，針對其黃豆來源及產(chǎn)品標(biāo)示共查察161項(xiàng)大豆油脂及醬油產(chǎn)品，產(chǎn)品標(biāo)示皆符合規(guī)定。此外，“食藥署”于2016年度也已規(guī)劃辦理“機(jī)關(guān)學(xué)校福利社及午餐膳業(yè)稽查項(xiàng)目”、“餐盒食品工廠HACCP稽查項(xiàng)目”及“豆制品制造業(yè)稽查項(xiàng)目”，持續(xù)針對校園午餐及食材部分進(jìn)行基因改造食品標(biāo)示及來源查核，以保障消費(fèi)大眾權(quán)益。

    “食藥署”提醒業(yè)者，基因改造食品標(biāo)示的新制已實(shí)施，如經(jīng)查獲產(chǎn)品未依規(guī)定標(biāo)示，依食品安全衛(wèi)生管理法第47條規(guī)定，處新臺幣3萬至300萬元罰款；如標(biāo)示有不實(shí)、夸張或易生誤解等違反同法第28條規(guī)定的情形，依據(jù)同法第45條第1項(xiàng)規(guī)定，處新臺幣4萬元以上400萬元以下罰款。