種業(yè)是花鱸全產業(yè)鏈的“壓艙石”,是廣東省發(fā)展現(xiàn)代化海洋牧場的原動力。目前,雖然花鱸養(yǎng)殖面積和產量逐年增加,但花鱸育種工作依賴傳統(tǒng)育種技術,育種進程緩慢,尚無符合現(xiàn)代化海洋牧場產業(yè)化需求,具有速生、抗風浪、低餌料系數(shù)等經濟性狀優(yōu)良品種見諸報端;此外,廣東省乃至全國野生花鱸基因資源污染嚴重,繁殖所用的南北方花鱸種群混雜,質量參差不齊。花鱸種質質量退化嚴重,導致生長速度減慢、抗病能力降低、病害頻發(fā),種質問題已經成為廣東省現(xiàn)代化海洋牧場花鱸種業(yè)的空前挑戰(zhàn),全面開展基因芯片等高效的現(xiàn)代分子育種技術研究,將有助于加速花鱸育種進程,助力現(xiàn)代化海洋牧場建設。
為解決產業(yè)面臨的“卡脖子”問題,創(chuàng)建花鱸精準高效育種技術體系,中國水產科學研究院南海水產研究所院級花鱸基因資源評價與遺傳育種創(chuàng)新團隊基于前期自行構建的高質量基因組數(shù)據(jù),結合GenoBaits?技術體系,研發(fā)了具有自主知識產權的首個花鱸40K液相育種芯片“海鱸1號”。這是一款應用于篩選、創(chuàng)制具有速生、抗逆、抗病、抗風浪等經濟性狀,且滿足深遠海養(yǎng)殖、陸基池塘、工廠化循環(huán)水等多種生產需要的花鱸新品種/系所特制的種業(yè)芯片,能夠實現(xiàn)快速、精準、高效的分子育種,助力花鱸種業(yè)創(chuàng)新發(fā)展。
“海鱸1號”液相芯片共計包括279個GWAS分析性狀關聯(lián)標記,以及41705個基于遺傳連鎖關系挑選的基因組均勻分布的背景位點,其平均檢出率高達99.25%~99.71%,分型一致性高達98.64%,平均覆蓋度為99.21%,平均位點缺失率為0.55%。該芯片具有基因組上均勻分布、多態(tài)性高等特點,可以實現(xiàn)高效的群體劃分、親權關系鑒定、分子標記輔助選育、全基因組選擇等諸多功能,且基因分型+全基因組關聯(lián)分析(GWAS)周期僅需2周左右,在基因組選擇育種中展現(xiàn)出廣闊應用前景。
