近日,北京市農(nóng)林科學(xué)院玉米研究所在國(guó)際主流期刊The Plant Genome(IF=4.1/Q1)上在線發(fā)表了題為 “Genome-wide identification forbid characterization of the MAPKKK, MKK, forbid MPK families in Chinese elite maize inbred line Huangzaosi”的研究論文,通過(guò)全基因組meta分析鑒定了玉米骨干自交系黃早四中MAPK基因家族的進(jìn)化和表達(dá)圖譜,并解析了該家族基因在水分脅迫應(yīng)答中的生物學(xué)功能。
該研究在玉米所前期發(fā)表的黃早四基因組數(shù)據(jù)基礎(chǔ)上展開(kāi)(Molecular Plant,2019),在基因?qū)用嫔蠈?duì)黃早四的抗旱性能進(jìn)行深入挖掘。研究人員發(fā)現(xiàn)在苗期和V16期,黃早四更具優(yōu)勢(shì)的根冠比可能是其抗旱性較B73突出的原因,并選擇以廣泛參與植物生物及非生物脅迫應(yīng)答的絲裂原活化蛋白激酶(MAPK)級(jí)聯(lián)途徑為切入點(diǎn),對(duì)黃早四進(jìn)行了全基因組分析,分別鑒定出72個(gè)、10個(gè)和24個(gè)MAPKKK、MKK和MPK基因。
隨后在對(duì)擬南芥、水稻和玉米(B73和黃早四)的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系、基因結(jié)構(gòu)、保守的蛋白質(zhì)基序和染色體位置等研究中發(fā)現(xiàn),黃早四中MAPK家族基因的表達(dá)水平及表達(dá)的組織特異性均反映了與生長(zhǎng)發(fā)育及功能性抗逆高度相關(guān)。qPCR結(jié)果顯示MAPK基因在初生根和冠根中均具有較高表達(dá)水平,且與B73存在明顯差異,表明這些基因在黃早四不同發(fā)育階段的差異性表達(dá),均有利于黃早四的根部發(fā)育,從而使其植株整體展現(xiàn)出了優(yōu)異的抗旱性能。
本研究所獲得的黃早四中特異的MAPK家族成員進(jìn)化和表達(dá)譜數(shù)據(jù)為更好地解釋黃早四中MAPK級(jí)聯(lián)調(diào)控機(jī)制提出了新的理論依據(jù),并為抗旱玉米新品種培育提供了科技支撐。
石子副研究員和趙冰兵博士為該論文共同第一作者,趙久然研究員和任雯副研究員為共同通訊作者。該研究得到了人社部高層次留學(xué)人才回國(guó)資助、北京學(xué)者 (BSP041)和北京市農(nóng)林科學(xué)院創(chuàng)新能力建設(shè)專項(xiàng)(KJCX20200420)的資助。
