近日,中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京畜牧獸醫(yī)研究所牛遺傳育種科技創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)通過整合多組學(xué)數(shù)據(jù),全面解析了肉牛體重相關(guān)性狀形成的遺傳機(jī)制,為闡明復(fù)雜相關(guān)性狀的遺傳機(jī)制提供了新見解,也為家畜遺傳改良提供了重要理論基礎(chǔ)和技術(shù)支撐。相關(guān)研究成果發(fā)表在《基因組蛋白質(zhì)組與生物信息學(xué)報(bào)(Genomics, Proteomics & Bioinformatics)》上。
肉牛體重相關(guān)性狀是肉牛新品種選育的重要目標(biāo)性狀。團(tuán)隊(duì)采用多組學(xué)整合策略,綜合利用肉牛(華西牛)全基因組測序數(shù)據(jù)、轉(zhuǎn)錄組、表觀組及 Hi-C等數(shù)據(jù),鑒定出兩個影響體重相關(guān)性狀的候選多效基因座LAP3-LCORL和PLAG1-CHCHD7。整合多組學(xué)功能注釋、選擇信號及分子驗(yàn)證等方法,捕獲 LAP3-LCORL 基因座中的變異(rs110242144)是體重相關(guān)性狀的候選多效變異。同時,綜合分析揭示LAP3-LCORL基因座的候選基因與人類身高、體重等性狀相關(guān),且該區(qū)域變異在多種家畜中均位于體重和胴體重QTL區(qū)域,表明基因可能經(jīng)歷了跨物種的平行進(jìn)化與選擇。
牧醫(yī)所牛群皓博士和武嘉遠(yuǎn)碩士為論文共同第一作者,徐凌洋研究員、李俊雅研究員以及George E. Liu研究員為論文共同通訊作者。本研究得到國家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃青年科學(xué)家項(xiàng)目、院科技創(chuàng)新工程、國家肉牛牦牛產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系等項(xiàng)目的資助。
原文鏈接:https://academic.oup.com/gpb/advance-article/doi/10.1093/gpbjnl/qzaf067/8237396
