鱖魚是我國重要的淡水優(yōu)質(zhì)魚類，也是我國漁業(yè)轉(zhuǎn)方式、調(diào)結(jié)構(gòu)的首選品種之一。解決鱖魚攝食活餌養(yǎng)殖成本高、生長速度下降、成活率低、病害頻發(fā)等問題成為鱖魚新品種培育的重要方向。因此，利用高效的現(xiàn)代分子育種技術(shù)，研發(fā)創(chuàng)制基因芯片，對(duì)開展鱖魚選育具有重要意義。

 

　　中國水產(chǎn)科學(xué)研究院珠江水產(chǎn)研究所鱖鱸基因組學(xué)與選擇育種創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)與華智生物技術(shù)有限公司合作，利用cGPS（Genotyping by Pinpoint Sequencing of captured targets）靶向測(cè)序技術(shù)，研發(fā)了具有自主知識(shí)產(chǎn)權(quán)的首個(gè)鱖魚40K液相育種芯片“鱖芯1號(hào)”。該芯片可應(yīng)用于鱖魚種質(zhì)資源鑒定、遺傳多樣性評(píng)估、基因定位與挖掘鑒定、全基因組關(guān)聯(lián)分析、分子輔助定向改良和智能育種等不同場(chǎng)景，為鱖魚遺傳研究和品種選育提供了高效基因型鑒定工具。利用該芯片可篩選獲得優(yōu)良性狀的鱖魚新品種，還將進(jìn)一步降低選育成本，助力鱖魚全基因組選育和良種創(chuàng)新研究。

 

　　該芯片位點(diǎn)多態(tài)性高、基因組分布均勻，位點(diǎn)在染色體上的平均覆蓋率為99.87%，平均間距17Kb。性狀關(guān)聯(lián)位點(diǎn)豐富，芯片包括團(tuán)隊(duì)前期研究篩選獲得的鱖魚馴食、性別和生長性狀關(guān)聯(lián)的分子標(biāo)記554個(gè)，可用于生長、性別和馴食等重要性狀的精準(zhǔn)鑒定和挖掘利用。芯片技術(shù)參數(shù)優(yōu)良，平均位點(diǎn)檢出率為99.35%，重復(fù)樣本基因型平均一致率為99.51%，與重測(cè)序樣本基因型比對(duì)平均一致率為99.11%。芯片整體性能優(yōu)良，穩(wěn)定性好，基因型準(zhǔn)確度高。

 

　　負(fù)責(zé)“鱖芯1號(hào)”研發(fā)的核心成員包括團(tuán)隊(duì)負(fù)責(zé)人孫成飛副研究員、葉星研究員、董浚鍵助理研究員等。更多相關(guān)訊息詳見https://mp.weixin.qq.com/s/j4F_9Uufw9d7mSOGwUmzNQ。