近日，山東省農(nóng)業(yè)科學(xué)院農(nóng)作物種質(zhì)資源研究所在《Genomics》（IF=6.205）上在線發(fā)表題為“De novo full length transcriptome analysis of Arachis glabrata provides insights into gene expression dynamics in response to biotic and abiotic stresses”的研究論文，系統(tǒng)解析了野生花生資源Arachis glabrata的轉(zhuǎn)錄組及對生物和非生物脅迫的響應(yīng)，為野生花生A. glabrata抗病基因的挖掘利用奠定了基礎(chǔ)。

 

　　利用野生種質(zhì)資源中的優(yōu)異基因改良農(nóng)作物，是農(nóng)作物新品種培育的重要途徑。花生是我國總產(chǎn)第一的油料作物。花生屬有80個(gè)野生種，野生資源在經(jīng)歷長期自然選擇的過程中積累了很多的優(yōu)良性狀，具有豐富的抗逆基因，是花生抗病、抗蟲、抗干旱種質(zhì)創(chuàng)新的重要基因庫。利用生物技術(shù)手段，充分發(fā)掘和利用野生花生中的有益基因資源是花生種質(zhì)創(chuàng)新的重要突破點(diǎn)。A. glabrata被認(rèn)為是抗病性最強(qiáng)的花生野生種，對葉斑病免疫，對銹病、花生斑駁病毒、青枯病和根結(jié)線蟲高抗，但由于缺乏A. glabrata的基因序列信息，限制了這些優(yōu)異基因的應(yīng)用。

 

　　該研究通過PacBio技術(shù)獲得了A. glabrata的首個(gè)全長轉(zhuǎn)錄組，包含了10.9萬多個(gè)轉(zhuǎn)錄本，并利用RNA-seq技術(shù)對所有轉(zhuǎn)錄本A. glabrata的根、莖、葉、花、果針、莢果中的表達(dá)的進(jìn)行了量化，揭示了這些轉(zhuǎn)錄本對葉斑病、干旱、高鹽和低溫脅迫的響應(yīng)，為從A. glabrata中克隆優(yōu)異基因、開發(fā)分子標(biāo)記奠定了基礎(chǔ)。在美國，部分A. glabrata資源已經(jīng)被馴化成了牧草品種，該研究發(fā)現(xiàn)A. glabrata的轉(zhuǎn)錄本中含有30多個(gè)調(diào)控A. glabrata葉片牧草品質(zhì)的關(guān)鍵基因，為A. glabrata牧草品質(zhì)的進(jìn)一步改良提供了思路。

 

　　農(nóng)作物種質(zhì)資源研究所趙傳志博士和廣西農(nóng)科院的賀梁瓊博士為該論文的共同第一作者，王興軍研究員為該論文的通訊作者。國際熱帶半干旱地區(qū)作物研究所、山東師范大學(xué)的相關(guān)研究團(tuán)隊(duì)也參與了該研究。該研究得到了國家自然科學(xué)基金國際（地區(qū)）合作與交流項(xiàng)目（31861143009）、面上項(xiàng)目（32072090），國家外專局高端外國專家引進(jìn)計(jì)劃（GL20200123001），山東省農(nóng)業(yè)良種工程（2020LZGC001），山東省泰山學(xué)者項(xiàng)目（ts20190964），廣西自然科學(xué)基金（2018GXNSFAA281079），廣西野生花生種質(zhì)資源圃和我院創(chuàng)新工程（CXGC2018E13, CXGC2016B02）的資助。

 

　　原文連接：https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0888754321001221。