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    南京農(nóng)業(yè)大學(xué)沈其榮教授課題組在枯萎病土壤微生物特征解析及發(fā)病預(yù)測方面取得重要進(jìn)展

    放大字體  縮小字體 時間:2020-10-22 09:26 來源:南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 原文:
    核心提示:當(dāng)?shù)貢r間7月17日,南京農(nóng)業(yè)大學(xué)沈其榮教授課題組通過對全球1500多個土壤測序樣品的整合分析,在枯萎病土壤微生物特征解析及發(fā)病預(yù)測方面取得重要進(jìn)展。
      鐮刀菌枯萎病作為土傳病害的典型代表,在世界范圍內(nèi)的多種作物頻繁爆發(fā)。在過去的幾十年里,相關(guān)學(xué)者進(jìn)行了大量案例研究發(fā)現(xiàn),盡管枯萎病爆發(fā)與土壤中病原菌豐度呈正相關(guān)關(guān)系,但并不存在可以確定是否發(fā)病的閾值。土壤是一個化學(xué)組成復(fù)雜、物理相系交錯、生物及功能神秘的體系,對鐮刀菌的存活及致病能力影響難以揭示,但普遍認(rèn)為土壤抑病功能很難從個別微生物及功能上說明問題。因此,從分子生態(tài)學(xué)角度出發(fā),以整合分析的方法來解析發(fā)病土壤微生物群落的普遍性特征,有望能為更好地防控土傳枯萎病提供解決方案。

      當(dāng)?shù)貢r間7月17日,南京農(nóng)業(yè)大學(xué)沈其榮教授課題組通過對全球1500多個土壤測序樣品的整合分析,在枯萎病土壤微生物特征解析及發(fā)病預(yù)測方面取得重要進(jìn)展。研究結(jié)果以“Predicting disease occurrence with high accuracy based on soil macroecological patterns of Fusarium wilt”為題發(fā)表在國際微生物領(lǐng)域頂級期刊《The ISME Jounal》上。課題組袁軍博士和博士生文濤為論文共同第一作者,沈其榮教授為通訊作者,美國亞利桑那州立大學(xué)的C Ryan Penton和美國農(nóng)業(yè)部的Linda Thomashow參與了該項研究。

      研究發(fā)現(xiàn),較高的尖孢鐮刀菌相對豐度是發(fā)病土壤的一個重要特征,但無法用于區(qū)分土壤的健康程度;健康土壤中非致病性鐮刀菌和鏈霉菌相對豐度較高,表明其可能與維持土壤健康有關(guān)。該研究在解釋群落特征的基礎(chǔ)上,使用機器學(xué)習(xí)分別構(gòu)建了細(xì)菌和真菌模型,該兩種模型在區(qū)分健康和發(fā)病土壤方面準(zhǔn)確度高達(dá)85%以上。并開放了在線比對服務(wù),供其他研究者以測序數(shù)據(jù)用于健康和發(fā)病土壤的區(qū)分。

      據(jù)了解,沈其榮教授課題組多年來從事土傳病害的土壤微生物區(qū)系特征解析與防控等研究工作,先后在Nat Biotechnol, Nat Microbiol, Nat Commun, Sci Adv, The ISME J, Microbiome, Ecol Lett等國際頂級刊物上發(fā)表了研究論文,彰顯了該團(tuán)隊在土壤微生物研究領(lǐng)域的領(lǐng)先地位。該研究受到了國家自然科學(xué)基金項目、農(nóng)業(yè)公益性行業(yè)專項、江蘇省自然科學(xué)基金等項目的資助。

      全文鏈接:https://www.nature.com/articles/s41396-020-0720-5
    日期:2020-10-22
     
     地區(qū): 南京市 江蘇
     行業(yè): 食品檢測
     標(biāo)簽: 微生物
     科普: 微生物
     
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