3月12日，Horticulture Research（中科院一區(qū)，IF：8.7）以封面文章（2024年第2期）在線發(fā)表了院園藝研究所/岳麓山實驗室果樹品種創(chuàng)制中心聯(lián)合華中農業(yè)大學果蔬園藝作物種質創(chuàng)新與利用全國重點實驗室和中國農業(yè)科學院深圳農業(yè)基因組所合作完成的題為《Phased genomics reveals hidden somatic mutations and provides insight into fruit development in sweet orange》的研究論文。

 

　　該研究從頭組裝了二倍體“錦和”冰糖橙的高質量單倍型基因組。與前期參考基因組比較，本研究組裝出了10.6%的新序列。甜橙基因組的兩套單倍型具有顯著序列差異，干擾了體細胞變異的準確檢測。本研究開發(fā)出一種基于單倍型鑒定體細胞變異的方法，結合甜橙無性系的基因組重測序數(shù)據(jù)，構建了二倍體甜橙體細胞變異的完整圖譜。通過對一組遺傳背景高度一致、果實大小差異顯著的體細胞變異品種“錦和”冰糖橙進行轉錄組測序分析。結合體細胞變異圖譜和等位基因特異表達分析，鎖定了與果實大小發(fā)育緊密相關的雜合體細胞變異，對于甜橙育種改良具有重要意義。

 

　　“錦和”冰糖橙是院園藝研究所最新選育的高糖低酸、優(yōu)質大果型冰糖橙新品種。2023年11月28日中國柑桔學會組織相關專家對該新品種進行了現(xiàn)場測產和綜合評議，測量結果顯示其平均單果重超過200克，平均縱橫徑均超過70厘米，無核、低酸，風味較“錦和”濃郁。專家組一致認為“錦和”冰糖橙遺傳性狀穩(wěn)定，果大、味濃、綜合性狀優(yōu)良，是一個有發(fā)展前景的優(yōu)系。本研究為我國地方特色良種冰糖橙新品種選育提供了理論指導，同時為柑橘果實大小發(fā)育研究提供了參考。

 

　　作者團隊介紹：湖南省農業(yè)科學院園藝研究所為第一完成單位，園藝所陳鵬副研究員和華中農業(yè)大學徐強教授為論文的共同通訊作者，中國農業(yè)科學院深圳農業(yè)基因組所博士后王楠，園藝所許園園為論文的共同第一作者。華中農業(yè)大學鄧秀新院士、伊華林教授和Robert M. Larkin教授，基因組所周永鋒研究員，園藝所李先信研究員、郭玲霞博士等參與了該研究。該研究得到國家重點研發(fā)項目（2022YFF1003100，2019YFD1001400）、湖南省農業(yè)科技創(chuàng)新資金項目（2022CX127，2023CX71）和湖南省自然科學基金項目（2021JJ40308）資助。

 

　　論文鏈接：https://doi.org/10.1093/hr/uhad268