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    湖南省農業(yè)科學院園藝所在“錦和”冰糖橙無性系變異和果實大小發(fā)育研究取得進展

    放大字體  縮小字體 時間:2024-03-15 09:08 來源:湖南省農業(yè)科學院 作者: 許園園   原文:
    核心提示:3月12日,Horticulture Research(中科院一區(qū),IF:8.7)以封面文章(2024年第2期)在線發(fā)表了院園藝研究所/岳麓山實驗室果樹品種創(chuàng)制中心聯(lián)合華中農業(yè)大學果蔬園藝作物種質創(chuàng)新與利用全國重點實驗室和中國農業(yè)科學院深圳農業(yè)基因組所合作完成的題為《Phased genomics reveals hidden somatic mutations and provides insight into fruit development in sweet orange》的研究論文。
      3月12日,Horticulture Research(中科院一區(qū),IF:8.7)以封面文章(2024年第2期)在線發(fā)表了院園藝研究所/岳麓山實驗室果樹品種創(chuàng)制中心聯(lián)合華中農業(yè)大學果蔬園藝作物種質創(chuàng)新與利用全國重點實驗室和中國農業(yè)科學院深圳農業(yè)基因組所合作完成的題為《Phased genomics reveals hidden somatic mutations and provides insight into fruit development in sweet orange》的研究論文。
     
      該研究從頭組裝了二倍體“錦和”冰糖橙的高質量單倍型基因組。與前期參考基因組比較,本研究組裝出了10.6%的新序列。甜橙基因組的兩套單倍型具有顯著序列差異,干擾了體細胞變異的準確檢測。本研究開發(fā)出一種基于單倍型鑒定體細胞變異的方法,結合甜橙無性系的基因組重測序數(shù)據(jù),構建了二倍體甜橙體細胞變異的完整圖譜。通過對一組遺傳背景高度一致、果實大小差異顯著的體細胞變異品種“錦和”冰糖橙進行轉錄組測序分析。結合體細胞變異圖譜和等位基因特異表達分析,鎖定了與果實大小發(fā)育緊密相關的雜合體細胞變異,對于甜橙育種改良具有重要意義。
     
      “錦和”冰糖橙是院園藝研究所最新選育的高糖低酸、優(yōu)質大果型冰糖橙新品種。2023年11月28日中國柑桔學會組織相關專家對該新品種進行了現(xiàn)場測產和綜合評議,測量結果顯示其平均單果重超過200克,平均縱橫徑均超過70厘米,無核、低酸,風味較“錦和”濃郁。專家組一致認為“錦和”冰糖橙遺傳性狀穩(wěn)定,果大、味濃、綜合性狀優(yōu)良,是一個有發(fā)展前景的優(yōu)系。本研究為我國地方特色良種冰糖橙新品種選育提供了理論指導,同時為柑橘果實大小發(fā)育研究提供了參考。
     
      作者團隊介紹:湖南省農業(yè)科學院園藝研究所為第一完成單位,園藝所陳鵬副研究員和華中農業(yè)大學徐強教授為論文的共同通訊作者,中國農業(yè)科學院深圳農業(yè)基因組所博士后王楠,園藝所許園園為論文的共同第一作者。華中農業(yè)大學鄧秀新院士、伊華林教授和Robert M. Larkin教授,基因組所周永鋒研究員,園藝所李先信研究員、郭玲霞博士等參與了該研究。該研究得到國家重點研發(fā)項目(2022YFF1003100,2019YFD1001400)、湖南省農業(yè)科技創(chuàng)新資金項目(2022CX127,2023CX71)和湖南省自然科學基金項目(2021JJ40308)資助。
     
      論文鏈接:https://doi.org/10.1093/hr/uhad268
    日期:2024-03-15
     
     
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