鱘魚金色卵魚子醬非常稀有,相較于其他顏色魚子醬經(jīng)濟價值更高,因此,對影響鱘魚卵顏色性狀潛在基因的探尋并提升育種效益是我院水產(chǎn)所胡紅霞研究員團隊承擔(dān)的鱘魚種業(yè)聯(lián)合攻關(guān)項目主要研究內(nèi)容之一。目前鱘魚卵顏色變異的遺傳基礎(chǔ)尚未見報道。
北京市農(nóng)林科學(xué)院水產(chǎn)所作為農(nóng)業(yè)農(nóng)村部鱘魚遺傳育種企業(yè)牽頭重點實驗室合作申報單位,與牽頭單位千島湖鱘龍科技有限公司合作,收集到62個金色卵(G)和黑色卵(B)俄羅斯鱘個體,進行了全基因組重測序分析研究。顯著富集的GO和KEGG通路與色素沉著(如蛋白質(zhì)消化和吸收以及視黃醇代謝等)和免疫(如嘌呤代謝、噬菌體和霍亂弧菌感染)有關(guān)。12個基因(ACTA1、ADCY3、ADCY5、ATP6V1C1、ATP6V1H、CHST11、COL6A3、GART、KCNJ13、RDH10、KCNN4和XDH)被鑒定為可能影響鱘魚卵顏色的候選基因。此外,應(yīng)用FST和XPEHH方法同時鑒定的四個基因(ATP6V1H、GART、RDH10和KCNN4)開發(fā)了四個KASP標(biāo)記,在其他28個俄羅斯鱘個體(13個金色和15個黑色)中成功驗證,達到極顯著水平(P值<0.01)。由兩個正選擇SNP構(gòu)建的單倍型對金色卵的預(yù)測準(zhǔn)確率達到92.86%。
這項研究為揭示鱘魚卵顏色的分子機制奠定了基礎(chǔ),并為金色卵鱘魚的選育提供了可靠的分子工具。相關(guān)內(nèi)容“Whole-genome resequencing of Russian sturgeon (Acipenser gueldenstaedtii) reveals selection signatures associated with caviar color”發(fā)表在水產(chǎn)領(lǐng)域?qū)I(yè)刊物Aquaculture 582 (2024) 740545。水產(chǎn)所胡紅霞研究員團隊宋海亮博士為第一作者,胡紅霞研究員與合作單位許式見高級工程師為共同通訊作者。
