國(guó)際著名學(xué)術(shù)期刊PLoS Pathogens于2021年7月24日在線發(fā)表了上海交通大學(xué)農(nóng)業(yè)與生物學(xué)院朱勃、陳功友聯(lián)合團(tuán)隊(duì)研究成果“A key antisense sRNA modulates the oxidative stress response and virulence in Xanthomonas oryzae pv. oryzicola”，揭示了稻黃單胞菌稻生致病變種Xanthomonas oryzae pv. oryzicola （Xoc）中sRNA適應(yīng)氧化應(yīng)激環(huán)境下對(duì)水稻致病性的研究機(jī)制。

 

　　原核生物和真核生物中除了三種經(jīng)典的 RNA，如 tRNA, rRNA,和 mRNA 外，還存在著一類新型的具有重要調(diào)控功能的非編碼RNA（ncRNA），在細(xì)菌中被統(tǒng)稱為 small  RNA（sRNA），大小在 50-500nt 之間，主要作用方式是通過(guò)堿基互補(bǔ)配對(duì)與靶標(biāo)基因 mRNA結(jié)合，進(jìn)而影響 mRNA 的穩(wěn)定性和翻譯從而在轉(zhuǎn)錄水平上調(diào)控基因表達(dá)。研究團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn)sRNA Xonc3711通過(guò)堿基互補(bǔ)配對(duì)靶標(biāo)DNA結(jié)合蛋白Xoc_3982影響其轉(zhuǎn)錄水平，ChIP-Seq表明Xoc_3982能夠與三型效應(yīng)因子XopC2結(jié)合從而影響其致病性。sRNA Xonc3711通過(guò)增加生物膜的形成來(lái)增加氧化應(yīng)激耐受性和和在水稻上的毒性（圖）。目前對(duì)于稻黃單胞菌稻生致病變種Xoc中sRNA的生物學(xué)功能仍處于研究初始階段，因此開展sRNA 的研究，并發(fā)現(xiàn)具有重要功能的 sRNA，對(duì)進(jìn)一步揭示細(xì)菌致病機(jī)理等和防控所致的植物病害提供了新的思路。

 

　　上海交通大學(xué)農(nóng)業(yè)與生物學(xué)院博士研究生吳言和王賽為論文的共同第一作者，上海交通大學(xué)長(zhǎng)聘教軌副教授朱勃和長(zhǎng)聘教授陳功友為論文的共同通訊作者。朱勃博士2017年以長(zhǎng)聘教軌副教授任職交大農(nóng)業(yè)與生物學(xué)院。該研究得到了科技部重點(diǎn)研發(fā)（項(xiàng)目編號(hào)2017YFD0201108和2018YFD0201202）等項(xiàng)目的資助。

 

　　論文鏈接：https://journals.plos.org/plospathogens/article?id=10.1371/journal.ppat.1009762