桃小食心蟲是蘋果、梨、桃等果樹上的重要害蟲，生產(chǎn)上主要通過套袋進(jìn)行防控，由于缺乏有效防控措施，該蟲的危害成為當(dāng)前制約果實(shí)免套袋栽培的重要因素（圖1）。國內(nèi)外主要從發(fā)生動(dòng)態(tài)、滯育特性、遺傳分化及環(huán)境適應(yīng)性等方面進(jìn)行研究，高質(zhì)量基因組的解析將進(jìn)一步推動(dòng)相關(guān)領(lǐng)域的研究進(jìn)展，以期為該蟲的預(yù)測(cè)預(yù)報(bào)和防控技術(shù)研究提供科學(xué)依據(jù)。
北京市農(nóng)林科學(xué)院植環(huán)所曹利軍博士等研究人員采用Illumina、PacBio測(cè)序平臺(tái)和Hi-C技術(shù)對(duì)桃小食心蟲基因組進(jìn)行測(cè)序，通過團(tuán)隊(duì)搭建的分析流程完成了染色體水平的基因組組裝和注釋，獲得30條常染色體和一條Z染色體，BUSCO評(píng)估完整度為98.3%（圖2）。對(duì)晝夜節(jié)律基因、解毒基因和化學(xué)受體基因家族進(jìn)行了注釋，發(fā)現(xiàn)桃小食心蟲除了谷胱甘肽S-轉(zhuǎn)移酶（GST）基因的數(shù)量較多以外，其它解毒基因家族基因數(shù)量和化學(xué)受體基因數(shù)量均低于大部分鱗翅目昆蟲。這是目前測(cè)定的第一個(gè)蛀果蛾科昆蟲的全基因組，豐富了對(duì)鱗翅目昆蟲基因組特征與演化的認(rèn)識(shí)。
該研究論文在國際知名刊物Molecular Ecology Resources上發(fā)表，基因組數(shù)據(jù)已在NCBI數(shù)據(jù)庫公開（BioProject PRJNA627116）。
曹利軍博士為論文第一作者，客座研究生宋威、博士后郭韶堃、博士后岳雷、宮亞軍副研究員、陳金翠助理研究員和澳大利亞墨爾本大學(xué)Ary Hoffmann教授等為論文共同作者，魏書軍研究員為論文通訊作者。
該項(xiàng)研究得到國家自然科學(xué)基金、北京市自然科學(xué)基金、北京市農(nóng)林科學(xué)院-墨爾本大學(xué)害蟲防控研究聯(lián)合實(shí)驗(yàn)室、北方果樹病蟲害綠色防控北京市重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室項(xiàng)目的資助。
全文鏈接：https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/1755-0998.13288
圖1. 桃小食心蟲卵、幼蟲、繭（蛹）和成蟲的特征（A-D）及對(duì)蘋果的危害狀（E-G）
圖2. 桃小食心蟲基因組特征（a）、連鎖群（b）及其與斜紋夜蛾（c上）和蘋果蠹蛾（c下）基因組的共線性分析
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