近日,西北農(nóng)林科技大學(xué)動科學(xué)院動物基因組與基因功能研究團隊在中國家驢遺傳結(jié)構(gòu)和體型大小受選擇信號領(lǐng)域取得進展,在《Journalof Genetics and Genomics》(中科院1區(qū)TOP期刊)上在線發(fā)表了題為《Genomic Analyses Reveal Distinct Genetic Architectures and Selective Pressures in Chinese Donkeys》的研究論文。我院在讀博士研究生沈加飛、于杰和代學(xué)雷為論文的第一作者,黨瑞華副教授為通訊作者。
該研究選取中國家驢12個代表性地方品種共78個樣本進行全基因組重測序,結(jié)合從公共數(shù)據(jù)庫下載的11個野驢全基因組數(shù)據(jù)共同進行分析,發(fā)現(xiàn)中國家驢祖先來源比較單一,但在群體結(jié)構(gòu)上具有明顯的地理分布特征,分為華北平原驢、黃土高原驢和西南高原驢三類。

(A)家驢群體結(jié)構(gòu);(B)家驢NJ樹;(C)家驢選擇信號與基因型分析
為揭示中國家驢體型差異的遺傳機制,研究人員對大型驢、中型驢和小型驢進行受選擇分析,在家驢3號染色體上發(fā)現(xiàn)2個與體高發(fā)育密切相關(guān)的明星基因NCAPG和LCORL,分別有11個和5個錯義突變位點,共同組成的基因型可以把大型驢與小型驢分開。
該研究解析了中國家驢的群體遺傳結(jié)構(gòu),篩選出影響中國家驢體型大小的關(guān)鍵候選基因與SNP錯義突變位點,為揭示中國家驢地方品種的遺傳多樣性、品種形成的遺傳機制及品種改良提供了理論依據(jù)。
全文鏈接:https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1673852721001776
