11月20日，由農(nóng)業(yè)農(nóng)村部科技教育司指導(dǎo)、中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院、中國農(nóng)學(xué)會、農(nóng)業(yè)農(nóng)村部科技發(fā)展中心聯(lián)合主辦的2020年中國農(nóng)業(yè)農(nóng)村科技發(fā)展高峰論壇在南京舉行。論壇上發(fā)布了《2020中國農(nóng)業(yè)科學(xué)重大進(jìn)展》，南京農(nóng)業(yè)大學(xué)張紹鈴教授團(tuán)隊研究成果“高雜合物種單倍型基因組組裝的新方法”成功入選。

 

　　植物基因組組裝大多采用二倍體或者多倍體材料進(jìn)行混合測序并組裝，對于一些雜合度低和重復(fù)序列比例少的物種而言，單倍型基因組組裝的難度并不是很凸顯，但是對于一些自交親和及高雜合的物種，單倍型染色體之間的差異會導(dǎo)致最終基因組存在大量嵌合組裝，而利用這種嵌合基因組將不利于這些物種的后續(xù)重測序、進(jìn)化、基因功能等方面的研究。

 

　　張紹鈴教授團(tuán)隊在成功組裝了世界首個梨基因組精細(xì)圖譜及變異圖譜的基礎(chǔ)上，利用12個花粉單細(xì)胞對所構(gòu)建的3.8萬條人工染色體（BAC，bacterial artificial chromosome）進(jìn)行單倍型分型，創(chuàng)建了基于“條形-編碼”（Bar-coding）的單倍型基因組組裝方法，成功組裝了梨兩套單倍型基因組。通過這種方法鑒定出了原參考基因組中8.12%的由于雜合引起的嵌合組裝基因，并對所測的‘碭山酥梨’基因組兩個單倍型之間的差異進(jìn)行了系統(tǒng)分析。同時，這種方法不僅可以利用花粉單細(xì)胞測序?qū)AC進(jìn)行分型，也可以結(jié)合多種長讀長測序技術(shù)（如Pacbio）用于解決復(fù)雜植物基因組的單倍型基因組組裝難題，有助于推動農(nóng)作物及經(jīng)濟(jì)作物等植物基因組的研究。

 

　　該研究成果于2019年10月在基因組研究權(quán)威期刊《Genome Research》上發(fā)表，南京農(nóng)業(yè)大學(xué)為第一完成單位，張紹鈴教授為通訊作者，南京農(nóng)業(yè)大學(xué)博士生施冬青為論文第一作者，吳俊教授、殷豪副教授以及福建農(nóng)林大學(xué)唐海寶教授為共同第一作者，吳巨友教授、陶書田教授、齊開杰老師、謝智華老師參與了該研究工作，并得到了國家重點研發(fā)計劃、國家自然科學(xué)基金重點項目的資助。

 

　　中國農(nóng)業(yè)科學(xué)重大進(jìn)展每年評選一次，遴選時以我國各類科研機(jī)構(gòu)正式發(fā)表的農(nóng)業(yè)領(lǐng)域高水平科學(xué)研究論文為基礎(chǔ)，根據(jù)“前沿引領(lǐng)、開創(chuàng)卓越、重大突破”的原則，經(jīng)過初選、專家評審及推薦、綜合遴選、解讀發(fā)布等過程，最終選出10項能夠充分代表當(dāng)年我國農(nóng)業(yè)科技前沿研究水平的基礎(chǔ)科學(xué)研究成果。