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    山東省農(nóng)業(yè)科學(xué)院蔬菜研究所在洋蔥高密度遺傳圖譜構(gòu)建及花薹高度相關(guān)SNP鑒定方面取得重要進(jìn)展

    放大字體  縮小字體 時(shí)間:2023-02-09 08:49 來(lái)源:山東省農(nóng)業(yè)科學(xué)院 原文:
    核心提示:本研究利用洋蔥兩個(gè)雙單倍體(DH-1×DH-17)為親本構(gòu)建的F2群體為研究材料,采用SLAF-seq技術(shù)構(gòu)建了洋蔥高密度遺傳圖譜。
      近日,山東省農(nóng)業(yè)科學(xué)院蔬菜研究所鱗莖類(lèi)蔬菜育種與栽培創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)洋蔥課題組在Frontiers in Plant Science(IF=6.627;JCR1區(qū),中科院2區(qū))發(fā)表了題為“Construction of a high-resolution genetic map and identification of single nucleotide polymorphism markers relevant to flower stalk height in onion”的研究論文。
     
      洋蔥(Allium cepa L.)具有重要的園藝和藥用價(jià)值,其分布廣泛,南北各地均有栽培,是國(guó)內(nèi)主栽蔬菜之一,也是出口創(chuàng)匯的主要蔬菜之一。由于洋蔥為二年生植物且其基因組龐大、重復(fù)序列較多、遺傳背景狹窄等原因,洋蔥高密度遺傳圖譜的構(gòu)建和基于圖譜的基因挖掘工作一直落后于番茄等其他蔬菜作物。
     
      本研究利用洋蔥兩個(gè)雙單倍體(DH-1×DH-17)為親本構(gòu)建的F2群體為研究材料,采用SLAF-seq技術(shù)構(gòu)建了洋蔥高密度遺傳圖譜。該遺傳圖譜全長(zhǎng)928.32 cM,平均圖距0.09 cM,包含8個(gè)連鎖群,10,584個(gè)多態(tài)SLAFs、21,250個(gè)SNP標(biāo)記。利用該圖譜,首先對(duì)調(diào)控雄性可育性狀(Ms)的位點(diǎn)進(jìn)行了QTL定位,定位結(jié)果與前人一致,說(shuō)明該遺傳圖譜具有較高的質(zhì)量。其次檢測(cè)到49個(gè)與花薹高度相關(guān)的SLAF標(biāo)記,其中20個(gè)SLAFs被認(rèn)為是花薹高度性狀雜種優(yōu)勢(shì)的有效有利等位變異標(biāo)記,可用于后期花薹高度相關(guān)基因或KASP標(biāo)記的開(kāi)發(fā)。本研究中構(gòu)建的高質(zhì)量高密度洋蔥連鎖圖譜為洋蔥花薹高度等重要農(nóng)藝性狀的精細(xì)定位和候選基因鑒定奠定了基礎(chǔ),也為洋蔥育種發(fā)育遺傳機(jī)制的研究提供了新思路。
     
      蔬菜研究所李艷偉博士為該論文第一作者,吳雄研究員和劉冰江研究員為該論文的共同通訊作者。該研究得到了國(guó)家蔬菜產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系和山東省農(nóng)業(yè)科學(xué)院農(nóng)業(yè)科技創(chuàng)新工程的資助。原文鏈接:https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fpls.2023.1100691/full(撰稿:李艷偉,核稿:王鳳德)
    日期:2023-02-09
     
     地區(qū): 山東 中國(guó)
     行業(yè): 果蔬
     標(biāo)簽: 洋蔥 蔬菜
     科普: 洋蔥 蔬菜
     
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