近日，牧醫(yī)所羊遺傳育種研究組發(fā)現(xiàn)調(diào)控德州驢肌肉發(fā)育的關(guān)鍵候選基因和lncRNA，該發(fā)現(xiàn)為提升德州驢肉用性能、培育德州驢肉用新品種提供了科學(xué)依據(jù)。
張莉研究員介紹，驢是草食動(dòng)物，屬馬科家畜，是肉食、阿膠、奶制品及驢副產(chǎn)品等的重要來源，在精準(zhǔn)扶貧和鄉(xiāng)村振興中發(fā)揮著重要作用。但驢產(chǎn)業(yè)發(fā)展始終受到養(yǎng)殖科技水平低、育種體系不完善等問題的制約。本研究以德州驢2個(gè)品系的背最長(zhǎng)肌和臀肌為研究對(duì)象進(jìn)行l(wèi)ncRNA建庫測(cè)序，共獲得24,683個(gè)基因和49,265條轉(zhuǎn)錄本，經(jīng)過比對(duì)共鑒定到3869個(gè)新的lncRNA。經(jīng)過不同組間的比較分析獲得了差異表達(dá)的lncRNA，并構(gòu)建了lncRNA-miRNA-mRNA相互作用網(wǎng)絡(luò)，發(fā)現(xiàn)了3個(gè)重要的關(guān)鍵候選lncRNA（MSTRG.9787.1, MSTRG.3144.1, MSTRG.9886.1）和4個(gè)關(guān)鍵候選基因（ACTN1, CDON, FMOD, BMPR1B）。通過KEGG生物信息學(xué)分析，發(fā)現(xiàn)TGF-β信號(hào)通路在德州驢肌肉發(fā)現(xiàn)中發(fā)揮重要作用。該研究為提高驢養(yǎng)殖效率、培育肉用驢新品種、促進(jìn)驢產(chǎn)業(yè)轉(zhuǎn)型升級(jí)提供了重要支撐。
相關(guān)研究成果發(fā)表在《基因 （genes）》（IF=“3.759）。碩士生石田培和助理研究員胡文萍為論文的共同第一作者，張莉研究員為通訊作者。該研究得到了院企合作研發(fā)項(xiàng)目《東阿黑驢重要經(jīng)濟(jì)性狀功能基因挖掘與鑒定》（2016-YF-05）的支持。
原文鏈接：https://www.mdpi.com/2073-4425/11/5/508
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