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    科學(xué)家構(gòu)建首個(gè)油菜基因轉(zhuǎn)錄數(shù)據(jù)庫

    放大字體  縮小字體 時(shí)間:2020-08-05 15:01 來源:中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院微信號 作者: 童超波   原文:
    核心提示:近日,中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院油料作物研究所油料作物基因組學(xué)與抗病性改良創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)破譯了油菜基因組的全轉(zhuǎn)錄信息密碼,構(gòu)建了油菜十萬余個(gè)基因的轉(zhuǎn)錄全景圖,使得油菜基因功能研究第一次有了標(biāo)準(zhǔn)的可參考的基因轉(zhuǎn)錄數(shù)據(jù)庫,將有力支撐油菜功能基因的相關(guān)研究。該項(xiàng)研究成果在線發(fā)表在《植物學(xué)報(bào)(The Plant Journal)》上。
      近日,中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院油料作物研究所油料作物基因組學(xué)與抗病性改良創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)破譯了油菜基因組的全轉(zhuǎn)錄信息密碼,構(gòu)建了油菜十萬余個(gè)基因的轉(zhuǎn)錄全景圖,使得油菜基因功能研究第一次有了標(biāo)準(zhǔn)的可參考的基因轉(zhuǎn)錄數(shù)據(jù)庫,將有力支撐油菜功能基因的相關(guān)研究。該項(xiàng)研究成果在線發(fā)表在《植物學(xué)報(bào)(The Plant Journal)》上。

      據(jù)團(tuán)隊(duì)首席科學(xué)家劉勝毅研究員介紹,油菜基因組包含約12億個(gè)堿基和十余萬個(gè)基因,如何解讀這些海量的基因組信息成為功能基因研究的重要任務(wù)。根據(jù)中心法則,基因通過轉(zhuǎn)錄形成mRNA再翻譯成蛋白質(zhì)。由于基因的轉(zhuǎn)錄通常存在多種可變的剪切方式,從而一個(gè)基因可以形成許多種不同的mRNA。此前,由于技術(shù)和資源的限制,油菜一直缺乏全基因組水平所有基因的轉(zhuǎn)錄mRNA數(shù)據(jù)庫,導(dǎo)致油菜基因功能研究缺乏可查詢和可參考的基因注釋信息。為了突破這一瓶頸,該團(tuán)隊(duì)采用最新的三代測序技術(shù)準(zhǔn)確測定了油菜全長轉(zhuǎn)錄組,并自主開發(fā)了一套用于多倍體油菜復(fù)雜基因組的分型方法,繪制了油菜基因組的轉(zhuǎn)錄全景圖,構(gòu)建了油菜“標(biāo)準(zhǔn)”的參考轉(zhuǎn)錄本數(shù)據(jù)庫。該研究成果更新了人們對油菜基因和基因組的認(rèn)識(shí)和理解,將為甘藍(lán)型油菜功能基因和遺傳改良研究及基因組設(shè)計(jì)育種提供數(shù)據(jù)基礎(chǔ)和理論指導(dǎo)。

      該研究得到國家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃項(xiàng)目、國家自然科學(xué)基金項(xiàng)目和中國農(nóng)科院科技創(chuàng)新工程等項(xiàng)目資助。
    日期:2020-08-05
     
     
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