臺灣地區(qū)對于轉(zhuǎn)基因食品依據(jù)食品安全衛(wèi)生管理法進(jìn)行管理，除須符合各項(xiàng)食品安全衛(wèi)生規(guī)定外，轉(zhuǎn)基因食品原料必須經(jīng)過安全性評估，取得查驗(yàn)登記許可，才能用作食品原料。

    2014年2月5日食品安全衛(wèi)生管理法修訂前，如果有用于食品中而尚未辦理查驗(yàn)登記的轉(zhuǎn)基因食品原料，例如供作榨油的油菜籽、棉花籽等，應(yīng)于2016年2月5日前完成辦理。臺灣地區(qū)FDA強(qiáng)調(diào)，轉(zhuǎn)基因食品原料業(yè)者，應(yīng)依“轉(zhuǎn)基因食品的安全性評估方法”備齊相關(guān)文獻(xiàn)數(shù)據(jù)，盡快申請查驗(yàn)登記審查。

    轉(zhuǎn)基因食品原料查驗(yàn)登記采用“源頭管理”的概念，通過審查許可的含特定轉(zhuǎn)殖品系的轉(zhuǎn)基因食品原料，才可進(jìn)一步制造、加工成為食品。以黃豆粉、分離大豆蛋白與濃縮大豆蛋白為例，其應(yīng)辦理查驗(yàn)登記的是該產(chǎn)品的原料—轉(zhuǎn)基因黃豆作物谷粒。