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    中國水產(chǎn)科學研究院生物中心在鯉抵抗嗜水氣單胞菌感染的分子機制方面取得新進展

    放大字體  縮小字體 時間:2021-10-09 09:26 來源:中國水產(chǎn)科學研究院 原文:
    核心提示:近日,中國水產(chǎn)科學研究院生物技術研究中心在鯉抵抗嗜水氣單胞菌感染的分子機制方面取得新進展。
      近日,中國水產(chǎn)科學研究院生物技術研究中心在鯉抵抗嗜水氣單胞菌感染的分子機制方面取得新進展,相關研究論文“Genomic features of common carp that are relevant for resistance against Aeromonas hydrophila infection”發(fā)表于水產(chǎn)類1區(qū)雜志《Aquaculture》(2020年JCR1區(qū),IF=4.242)。該論文得到國家重點研發(fā)計劃(2018YFD0900102)和中國水產(chǎn)科學研究院中央級公益性科研院所基本科研業(yè)務費專項資金(2018B003和2020TD24)資助。江炎亮副研究員為文章的第一及通訊作者,許建研究員為共同通訊作者。文章鏈接網(wǎng)址:https://authors.elsevier.com/sd/article/S0044-8486(21)01175-3.
     
      嗜水氣單胞菌是鯉魚養(yǎng)殖中危害最嚴重的致病菌之一。研究人員對易感和抗病的鯉魚進行全基因組重測序并開展全基因組關聯(lián)分析,定位到8個與抗病性狀顯著關聯(lián)的SNP位點(圖1),并進一步找到6個潛在關鍵基因,均為免疫相關基因:rab26,dcc,trim71,ptpn21,muc5b,trim25。8個顯著關聯(lián)的SNP中,有1個為非同義SNP,位于基因trim25的外顯子區(qū)域,可引發(fā)Trim25蛋白二級結(jié)構(gòu)的改變(圖2),且該基因在經(jīng)嗜水氣單胞菌感染后的鯉魚脾臟中顯著上調(diào)表達。研究結(jié)果表明鯉在基因組水平上的遺傳差異決定了其抵抗細菌感染的能力強弱,為全基因組選育鯉抗病新品系提供了必要的分子基礎。

      圖1. Manhattan 結(jié)果展示圖

      圖2. Trim25 蛋白二級結(jié)構(gòu)預測
    日期:2021-10-09
     
     
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