近日，林學(xué)院魏安智教授團(tuán)隊(duì)在園藝頂級期刊《Horticulture Research》在線發(fā)表了題為“Genomic analysis reveals the genetic diversity, population structure, evolutionary history and relationships of Chinese pepper”的研究論文。該論文系統(tǒng)地研究了花椒和竹葉花椒的遺傳多樣性、品種間的親緣關(guān)系及栽培起源，對花椒種質(zhì)資源的高效利用和保護(hù)具有重要意義。

 

　

 

　　該論文通過GBS簡化基因組測序技術(shù)對112份花椒和竹葉花椒種質(zhì)資源的遺傳多樣性進(jìn)行分析，鑒定到38,395個SNPs標(biāo)記。群體結(jié)構(gòu)分析表明，花椒主要分為三個分支，Clade I和Clade II分別位于秦嶺以北和秦嶺以南，而Clade III主要分布于西南地區(qū)。竹葉花椒的栽培群體和野生群體各自聚為一個分支，主要分布于西南地區(qū)。品種間親緣關(guān)系分析表明，花椒在進(jìn)化過程中發(fā)生過多次分化事件，花椒和竹葉花椒之間未發(fā)現(xiàn)近期基因滲入現(xiàn)象，然而種內(nèi)不同品種間卻檢測到基因滲入現(xiàn)象。該研究通過溯祖理論和物種潛在分布區(qū)模擬構(gòu)建了這兩個物種的種群動態(tài)歷史，推斷表明，花椒和竹葉花椒的分化時間距今約12 百萬年，氣候變化是花椒和竹葉花椒群體動態(tài)歷史形成的主要原因?；ń方?jīng)歷了長期穩(wěn)定的種群擴(kuò)張，其有效群體大小在末次冰川盛期急劇下降。而竹葉花椒的有效群體大小表現(xiàn)出較快的增長趨勢，到末次冰川盛期時增長減慢或停止增長。該研究進(jìn)一步通過馴化歷史模型分析推斷了花椒的栽培起源，甘肅武都可能是栽培花椒的起源中心。

 

　　我校博士后馮世靜，博士畢業(yè)研究生劉振山為該論文第一作者，魏安智教授為論文通訊作者。該研究得到了國家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃項(xiàng)目（2018YFD1000605）和國家林業(yè)和草原局科技發(fā)展中心項(xiàng)目（KJZXSA202025）的資助。

 

　　論文鏈接：https://www.nature.com/articles/s41438-020-00376-z