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    云南農(nóng)業(yè)大學(xué)發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)座子和生長素相互作用提高水稻避旱性

    放大字體  縮小字體 時(shí)間:2021-02-22 10:03 來源:云南農(nóng)業(yè)大學(xué) 原文:
    核心提示:在本研究中,首次發(fā)現(xiàn)插入月亮谷水稻DEEPER ROOTING 1(DRO1)基因啟動(dòng)子中的INDITTO2轉(zhuǎn)座子可以傳遞生長素信號(hào)調(diào)節(jié)DRO1的轉(zhuǎn)錄從而增強(qiáng)水稻避旱性。
      本站消息 近日,植物學(xué)領(lǐng)域重要國際期刊Plant, Cell and Environment(IF =6.362)在線發(fā)表了云南農(nóng)業(yè)大學(xué)植物保護(hù)學(xué)院杜云龍教授研究團(tuán)隊(duì)題為“INDITTO2transposon conveys auxin-mediatedDRO1transcription for rice drought avoidance”的研究論文。在本研究中,首次發(fā)現(xiàn)插入月亮谷水稻DEEPER ROOTING 1(DRO1)基因啟動(dòng)子中的INDITTO2轉(zhuǎn)座子可以傳遞生長素信號(hào)調(diào)節(jié)DRO1的轉(zhuǎn)錄從而增強(qiáng)水稻避旱性。

      轉(zhuǎn)座子是重要的可移動(dòng)DNA元件,廣泛存在于植物基因組中,在植物進(jìn)化中發(fā)揮著重要作用。生長素是一種重要的調(diào)節(jié)因子,與根系發(fā)育和干旱脅迫適應(yīng)有關(guān)。DRO1基因是水稻避旱的關(guān)鍵基因。秈稻月亮谷(Acuce)是云南省元陽哈尼梯田中的主栽特色農(nóng)家稻,具有產(chǎn)量穩(wěn)定、抗病性好等優(yōu)良農(nóng)藝性狀,其種植地區(qū)海拔高達(dá)1600-2000米,已經(jīng)有100多年的種植歷史。開展月亮谷水稻優(yōu)良農(nóng)藝性狀的遺傳基礎(chǔ)研究,特別是干旱脅迫下轉(zhuǎn)座子與DRO1基因在月亮谷水稻發(fā)育中的作用,對(duì)于揭示水稻對(duì)非生物脅迫和生物脅迫的適應(yīng)性機(jī)制具有重要的應(yīng)用價(jià)值和理論意義。

      圖1.大田種植的水稻根系構(gòu)型

      對(duì)月亮谷、日本晴、日本晴/dro1-cc突變體分別在灌溉(A)和干旱(B)條件下生長3個(gè)月,觀察根系構(gòu)型(C-H)及測量根的生長角度(I)(Acuce: nwater=13, ndrought=11;NPB:nwater=9, ndrought=6; NPB/dro1-cc: nwater=9, ndrought=5)。數(shù)據(jù)為平均值± SD; *P< 0.05, **P< 0.01 (Student'st-test)。NPB =日本晴,NPB/dro1-cc =日本晴/dro1-cc突變體,ND =無差異,θ=根角度,標(biāo)尺= 10 cm.

      研究團(tuán)隊(duì)結(jié)合基因編輯、生物信息學(xué)及分子生物學(xué)等技術(shù)手段,構(gòu)建了月亮谷水稻及日本晴水稻的DRO1基因敲除突變體,發(fā)現(xiàn)月亮谷水稻具有較強(qiáng)的避旱性(圖1),月亮谷水稻響應(yīng)干旱脅迫與DRO1基因的表達(dá)量上調(diào)有關(guān),其根系發(fā)育表現(xiàn)明顯的避旱性特征并與DRO1調(diào)節(jié)生長素的運(yùn)輸有關(guān)。為了探明DRO1基因影響水稻避旱性的差異與生長素的關(guān)系,對(duì)DRO1基因的啟動(dòng)子進(jìn)行分析。發(fā)現(xiàn)月亮谷水稻的DRO1基因啟動(dòng)子比日本晴水稻多了266個(gè)核苷酸,進(jìn)一步分析并確定其為轉(zhuǎn)座子,命名為INDITTO2,屬于微型反向重復(fù)轉(zhuǎn)座元件(MITE)家族的Tourist亞家族成員,是非自主型轉(zhuǎn)座子。INDITTO2轉(zhuǎn)座子含有生長素響應(yīng)元件(ARE),參與生長素介導(dǎo)的DRO1基因表達(dá),具有啟動(dòng)子活性,能夠?qū)⑸L素的轉(zhuǎn)錄調(diào)控傳遞到鄰近基因。通過轉(zhuǎn)基因的方法將INDITTO2轉(zhuǎn)座子插入到日本晴水稻的DRO1啟動(dòng)子中,可以顯著促進(jìn)水稻對(duì)干旱的適應(yīng)性。進(jìn)一步的研究發(fā)現(xiàn)INDITTO2轉(zhuǎn)座子及其同源基因廣泛分布于水稻基因組中(圖2),并參與了對(duì)生長素的響應(yīng)及基因表達(dá)調(diào)節(jié)。該研究揭示INDITTO2轉(zhuǎn)座子在基因組中的廣泛分布增加了水稻的遺傳多樣性,并發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)座子在作為啟動(dòng)子時(shí),可響應(yīng)水稻內(nèi)部的激素信號(hào)而調(diào)節(jié)基因表達(dá),從而增強(qiáng)水稻對(duì)不同非生物脅迫的適應(yīng)性。

      圖2. PCR擴(kuò)增不同水稻基因組中的INDITTO2轉(zhuǎn)座子及其同源基因

      INDITTO2轉(zhuǎn)座子在月亮谷水稻DRO1基因啟動(dòng)子中的示意圖(A)。凝膠電泳顯示45個(gè)水稻品種用基因特異引物PDI-FP和PDI-RP擴(kuò)增INDITTO2轉(zhuǎn)座子的PCR產(chǎn)物(B)。

      云南農(nóng)業(yè)大學(xué)植物保護(hù)學(xué)院杜云龍課題組已畢業(yè)碩士研究生趙宜婷、武麗霞以及在讀碩士研究生傅琪景為該論文的共同第一作者,杜云龍教授為唯一通訊作者。奧地利科學(xué)技術(shù)研究所Ji?í Friml教授、西南林業(yè)大學(xué)何霞紅教授、云南農(nóng)業(yè)大學(xué)植物保護(hù)學(xué)院李成云教授、黃惠川副教授、中國科學(xué)院西雙版納熱帶植物園劉長寧研究員、中國科學(xué)院昆明植物研究所王蕾副研究員、左之利研究員也參與了該工作。該研究獲得國家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(Grant No. 31460453,31660501,31860064和31470382)、云南省教育廳科學(xué)研究基金重大專項(xiàng)(Grant No. ZD2015005)、教育部“留學(xué)回國人員科研啟動(dòng)基金”(Grant No. [2013] 1792);、云南省科技廳重大科技計(jì)劃(Grant No. 2016ZF001)、云南省科技廳重點(diǎn)項(xiàng)目(Grant No. 2017FA018)等項(xiàng)目資助。

      原文鏈接:https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/pce.14029
    日期:2021-02-22
     
     
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