近日，中國水產(chǎn)科學(xué)研究院珠江水產(chǎn)研究所育種室趙建研究團(tuán)隊(duì)在月鱧（Channa asiatica）基因組資源解析取得了重要進(jìn)展。相關(guān)研究論文“A chromosome-level reference genome assembly of the Small snakehead （Channa asiatica）”已發(fā)表于SCI期刊《Scientific Data》（JCR1區(qū)，IF2025=6.9）。該研究得到了國家現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系（CARS-46）等項(xiàng)目的資助，珠江所為第一完成單位，劉海洋和劉嘉峰為第一作者，趙建研究員和歐密副研究員為共同通訊作者。
月鱧是一種具有重要經(jīng)濟(jì)價值的水產(chǎn)養(yǎng)殖和觀賞魚類，廣泛分布于中國南方及東南亞地區(qū)。由于其獨(dú)特的體表花紋和強(qiáng)大的生命力，月鱧在水產(chǎn)養(yǎng)殖和水族愛好者中深受青睞。然而，由于此前該物種的基因組資源較為匱乏，相關(guān)的遺傳學(xué)研究和育種項(xiàng)目尚未得到充分開展。
本研究團(tuán)隊(duì)采用PacBio HiFi長讀長測序、Illumina短讀長測序及Hi-C技術(shù)，成功構(gòu)建了月鱧雄性基因組的高質(zhì)量染色體水平組裝。最終組裝的基因組長度為659.44Mb，其中98.18%的序列成功錨定至23條染色體，展現(xiàn)了出色的基因組組裝質(zhì)量。該基因組的contig N50和scaffold N50分別為23.92Mb和29.61Mb，顯示出高水平的組裝結(jié)果。
在基因注釋方面，研究團(tuán)隊(duì)共鑒定出26,603個編碼蛋白質(zhì)的基因，且BUSCO評估完整度達(dá)到99.29%，功能注釋率為93.68%。通過與烏鱧（C. argus）、斑鱧（C. maculata）等近緣物種的基因組共線性比較，研究揭示了鱧科魚類染色體的進(jìn)化規(guī)律。本研究為月鱧功能基因研究、比較基因組學(xué)及進(jìn)化研究奠定了堅(jiān)實(shí)的基礎(chǔ)。通過對基因組數(shù)據(jù)的深入分析，研究團(tuán)隊(duì)期望在未來能識別與關(guān)鍵經(jīng)濟(jì)性狀相關(guān)的功能基因，推動月鱧的精準(zhǔn)育種和遺傳改良。
全文鏈接：https://doi.org/10.1038/s41597-025-05479-7
