大口黑鱸是我國(guó)重要的淡水養(yǎng)殖品種，2023年全國(guó)養(yǎng)殖產(chǎn)量達(dá)到88.80萬噸，在國(guó)民經(jīng)濟(jì)中占有重要地位。目前大口黑鱸國(guó)審新品種僅有2個(gè)，新品種的數(shù)量與大口黑鱸養(yǎng)殖產(chǎn)業(yè)規(guī)模不匹配。亟需開發(fā)新的新品種，尤其是具有抗逆等性狀的新品種。研發(fā)創(chuàng)制基因組芯片，可以為加速大口黑鱸的育種進(jìn)程，提高育種效率奠定基礎(chǔ)。
中國(guó)水產(chǎn)科學(xué)研究院珠江水產(chǎn)研究所鱖鱸基因組學(xué)與選擇育種創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)與康普森生物技術(shù)有限公司合作，利用CAGT®（Compass Agriculture Genomic Technology）靶向捕獲測(cè)序技術(shù)，研發(fā)了具有自主知識(shí)產(chǎn)權(quán)的大口黑鱸50 K液相育種芯片“鱸芯1號(hào)”。該芯片可應(yīng)用于大口黑鱸種質(zhì)資源鑒定、遺傳多樣性評(píng)估、基因定位與挖掘鑒定、全基因組關(guān)聯(lián)分析、分子輔助定向改良和基因組育種等不同場(chǎng)景，為大口黑鱸遺傳研究和品種選育提供了高效基因型鑒定工具。利用該芯片將來可進(jìn)一步研發(fā)低密度芯片，降低選育成本，助力大口黑鱸全基因組選育和良種創(chuàng)新研究。
該芯片位點(diǎn)多態(tài)性高、基因組分布均勻，位點(diǎn)在染色體上的平均覆蓋率為99.65%，平均間距17 Kb。性狀關(guān)聯(lián)位點(diǎn)豐富，芯片包括團(tuán)隊(duì)前期研究篩選獲得的多個(gè)功能位點(diǎn)，可用于生長(zhǎng)、性別和抗病毒等重要性狀的精準(zhǔn)鑒定和生產(chǎn)應(yīng)用。“鱸芯1號(hào)”技術(shù)性能優(yōu)良，而且芯片穩(wěn)定性好，基因分型準(zhǔn)確度高，測(cè)試結(jié)果顯示平均位點(diǎn)檢出率達(dá)99.95%，重復(fù)樣本基因型平均一致率為99.95%。
負(fù)責(zé)“鱸芯1號(hào)”研發(fā)的核心成員包括崗位科學(xué)家高風(fēng)英特聘研究員，董浚鍵助理研究員、孫成飛副研究員、葉星研究員等。“鱸芯1號(hào)”的研制得到國(guó)家特色淡水魚技術(shù)體系淡水鱸種質(zhì)資源與品種改良崗位（CARS-46）、中國(guó)水產(chǎn)科學(xué)研究院基本科研業(yè)務(wù)費(fèi)（2023TD95）等項(xiàng)目的支持。
